Projekt je zaměřen na vyhledávání vybraných archeologických lokalit, jejich výzkum, stanovení jejich možného ohrožení a vypracování metodik jejich ochrany, záchrany, výzkumu a využití. Jedná se o společný projekt Masarykovy univerzity Brno, Mendelovy lesnické a zemědělské univerzity Brno, Archaia Brno, o.p.s., Muzea Vysočiny Jihlava, p.o. a dalších institucí.

Implementace národních strategií ochrany přírody a biodiverzity v úzké spolupráci s místními a regionálními institucemi, veřejností a neziskovým sektorem. Zpracování výskytu a rozšíření vybraných skupin organismů v Kraji Vysočina se zaměřením na chráněné a ohrožené druhy. Vyhodnocení významných míst biodiverzity v rámci Kraje Vysočina. Získaná data a zpracované studie přispějí k aktuálnímu poznání stavu vybraných skupin organismů a povedou k účinnější ochraně přírodního bohatství regionu. Projekt realizovaný ve spolupráci s Českou společností ornitologickou na Vysočině.

Projekt realizovaný ve spolupráci s AV ČR si klade za cíl ověřit na modelovém příkladu praktické možnosti při hledání provenience historických stavebních surovin - mramorů a pojiva malt z objektů památkově chráněného kláštera ve Žďáře nad Sázavou.

Cílem projektu je optimalizace konzervačního postupu - výzkum kvality a rychlosti pronikání roztoku do struktury dřeva, doplněný o zjištění mechanických a fyzikálních vlastností konzervovaných dřev, a výzkum jejich degradace v uměle vytvořených podmínkách - vliv změny klimatických podmínek, UV záření, biologických škůdců apod. Impregnace vodou nasyceného dřeva je dlouhodobý proces.

Celkem 8 kusů - 4 diplomy týkající se činnosti střeleckého spolku (1821, 1828, 1839, 1893), po 1 kusu Českého řemeslnického spolku v Jihlavě (1885), Jihlavského sboru dobrovolných hasičů (1896), Jihlavského spolku vojenských vysloužilců (1897) a 1 diplom z Jihočeské hospodářsko-průmyslové a národopisné výstavy v Táboře (1902)

inv. číslo: Ji-25/C/574, datace: 1790, rozměry: 44 x 72 cm, akvarel s temperou

6. část, praporec cechu řezníků, inv. číslo: Ji-7/E/16

V rámci tohoto projektu byly do září 2014 vybudovány nové expozice: expozice nejstarších dějin Jihlavska,
expozice dějin 20. století na Jihlavsku, Lapidárium a expozice živé přírody na Jihlavsku (čtyři výstavní prostory).
Projekt byl podpořen z operačního programu ROP NUTS II Jihovýchod, celkové výdaje projektu byly 12,7 mil. Kč.